芳村原本名為“方村”。據(jù)說(shuō)西漢末年王莽篡位，有一位忠于漢室的方姓大臣，為免受王莽的迫害，攜帶家人，棄官南下福建，隱居避難。

過(guò)了數(shù)百年，這支方姓家族的一支宗親從福建遷來(lái)常山縣北郊西山村附近，見這里田地平曠，環(huán)境幽雅，很適合繁衍生息，便在此定居下來(lái)。

后來(lái)，村民們?cè)诖蹇诮ㄔ炝艘蛔鶝鐾?，亭門上題寫了“方村”二字，從此“方村”就成了這里的地名。如今，芳村民間還流傳著一句俗語(yǔ):“先有西山，后有芳村?！币馑际俏魃降臍v史早于芳村或是芳村最早是源于西山村的。

芳村是花卉之鄉(xiāng)，以花名世，歷史悠久，是嶺南盆景藝術(shù)發(fā)祥地之一。南漢時(shí)期，花地就以盛產(chǎn)素馨、茉莉而名聞天下。元代孫蕡稱花地為“素馨茉莉天香國(guó)”。明清時(shí)代，品種越來(lái)越繁，素有“嶺南第一花鄉(xiāng)”的美譽(yù)。1949年11月，由芳村、崇文（崇文二十四鄉(xiāng)）兩區(qū)合并成芳村區(qū)。2005年4月28日，撤銷廣州市芳村區(qū)，將原芳村區(qū)的行政區(qū)域劃歸荔灣區(qū)管轄。