和普通公司注冊的流程一樣，營利性的去工商部門登記，民辦非企業(yè)單位去民政局登記。

1、根據《個體工商戶名稱登記管理辦法》、《企業(yè)名稱登記管理規(guī)定》等相關法規(guī)、規(guī)章規(guī)定，除公司制企業(yè)外，包括個體工商戶、個人獨資企業(yè)、合伙企業(yè)名稱可用“廠”、“店”、“館”、“部”、“行”、“中心”等，也就是說可以使用“研究所”。
2、《個體工商戶名稱登記管理辦法》規(guī)定個體工商戶名稱中行政區(qū)劃為市轄區(qū)，您若申請個體工商戶名稱要表述為xx市樊城區(qū)xx研究所或xx區(qū)xx研究所，個人獨資企業(yè)、合伙企業(yè)可以表述為xx市xx研究所。
3、研究所可以到工商部門申請營業(yè)執(zhí)照登記，也可向民政部門申請民辦非企業(yè)單位登記，區(qū)別是民辦非企業(yè)單位從事非營利性社會服務活動，企業(yè)從事營利性社會服務活動。個體工商戶登記可以到轄區(qū)工商所申請，也可到行政服務中心申請；個人獨資企業(yè)、合伙企業(yè)登記需要到轄區(qū)工商所申請，建議就近辦理。